Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd4Q60688 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Foxd4Q60688 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms