Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Specc1Q5SXY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Specc1Q5SXY1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms