Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sco1Q5SUC9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sco1Q5SUC9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms