Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam71bQ5STT6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms