Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r223Q5SSA0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms