Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm3558Q5FWC9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3558Q5FWC9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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