Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prune2Q52KR3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prune2Q52KR3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prune2Q52KR3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prune2Q52KR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prune2Q52KR3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms