Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opa3Q505D7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Opa3Q505D7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Opa3Q505D7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Opa3Q505D7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opa3Q505D7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Opa3Q505D7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Opa3Q505D7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Opa3Q505D7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Opa3Q505D7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Opa3Q505D7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Opa3Q505D7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Opa3Q505D7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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