Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx33Q4VAA7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx33Q4VAA7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx33Q4VAA7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx33Q4VAA7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx33Q4VAA7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx33Q4VAA7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx33Q4VAA7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx33Q4VAA7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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