Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srek1ip1Q4V9W2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srek1ip1Q4V9W2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms