Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Krtap1-4Q3V2D6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms