Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp48Q3V0C5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp48Q3V0C5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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