Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933416C03RikQ3V063 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933416C03RikQ3V063 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms