Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaaf3Q3UYV8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms