Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc160Q3UYG1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms