Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E330034G19RikQ3UWX6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms