Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr1d1Q3UV55 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr1d1Q3UV55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms