Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B230104I21RikQ3USW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B230104I21RikQ3USW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms