Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkain3Q3URJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms