Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fhdc1Q3ULZ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fhdc1Q3ULZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms