Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc106Q3ULM0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc106Q3ULM0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms