Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc34Q3UI66 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms