Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnft2Q3UF64 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms