Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll12Q3UDE2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms