Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U6N9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms