Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms