Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hectd3Q3U487 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms