Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gse1Q3U3C9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gse1Q3U3C9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms