Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hhla1Q3TYV2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hhla1Q3TYV2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms