Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pip4p1Q3TWL2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pip4p1Q3TWL2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms