Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Treml4Q3LRV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Treml4Q3LRV9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms