Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim63Q38HM4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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