Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne9Q1RLL3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cpne9Q1RLL3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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