Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim71Q1PSW8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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