Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf3ip1Q149C2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf3ip1Q149C2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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