Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b1Q148W0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b1Q148W0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms