Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps8Q0P5W1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps8Q0P5W1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms