Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnma1Q08460 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kcnma1Q08460 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kcnma1Q08460 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms