Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F13bQ07968 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13bQ07968 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms