Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AmbpQ07456 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms