Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrstQ06666 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms