Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fmn1Q05860 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fmn1Q05860 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmn1Q05860 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms