Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox13Q04891 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox13Q04891 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms