Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox8Q04886 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms