Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msx2Q03358 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msx2Q03358 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms