Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Muc1Q02496 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Muc1Q02496 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms