Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd1Q01822 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms