Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec23aQ01405 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec23aQ01405 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms