Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2aQ01320 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Top2aQ01320 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top2aQ01320 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms