Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a2Q01149 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col1a2Q01149 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms